密西西比麝香龜體型比較小，是蛋龜品種里最小的一種，即便是這樣，它依然非常兇猛，是個典型的小個子有大脾氣。

　　密西西比麝香龜體長7.6-13.7 cm。這是一種性情活潑易怒的小型水龜，頭部有兩條淺色的條紋，下顎和喉部長有觸須。背甲光滑，或者有三條棱突，高隆而修長，沒有鋸齒;顏色棕橄欖色至深灰色，常常因披覆著一層藻類而顯得模糊不清。幼體的背甲上長有棱突和圖案，這些圖案為不規則的條紋或斑點，顏色深暗。

　　腹甲較小，有十一枚盾片和一個不怎么明顯的鉸鏈關節。雄性尾部的末端，有一個角狀的硬質釘突;而后肢的內側則綴有2小枚翹起的鱗片。雌性的尾部很短，末端形成一個銳利的尖角。