平背麝香龜是小麝香龜屬里比較有特點的龜，麝香龜又被人們稱之為蛋龜，主要的原因在于背甲像一枚雞蛋的殼，但是平背麝香龜的背甲卻沒有那么明顯的弧度，是呈扁平狀的。

　　平背麝香是小型的淡水龜，背甲非常的平坦，兩側的斜坡形成了一個大于100度的角度。幼體時，斜面的角度與高度的比率大約為9.5：1。背部中央有一條比較鈍的、不太明顯的脊椎骨。背甲前端兩側的緣盾略微呈鋸齒狀，每塊脊椎盾甲都與后方盾甲前端交迭，第1塊脊椎盾甲比較的長，從不于第2塊緣盾相接觸，另外4塊脊椎盾甲的寬度大于其自身的長度，第5塊則向后方擴展。背甲的顏色為黃褐色和咖啡色，伴有黑色或咖啡色的斑點與條紋。

　　頭部的大小適中，有不完全類似于鉤狀的上顎，在橄欖色頭背部是完美的黑色網狀條紋和斑點，在成體后有適度的擴大。某些成體的平背從鼻孔處到眼眶有著黃色的條紋，頸部有縱向的斑紋圖案，條紋比較窄，不如虎紋麝香那么明顯。下顎有一對觸須，四肢有腳蹼，雄性尾巴粗而長，顏色一般為褐色。